Kenetben nézzük meg mikroszkóp alatt a mikroorganizmusokat (baktériumokat, gombákat, vírusokat, protozoákat). Szintén mikrobiológiai vizsgálat a tenyésztés, melynek során a mintából különféle táptalajokra oltva tenyésztenek ki kórokozót, illetve akár azt is, hogy melyik antibiotikummal lehet tőle megszabadulni.